GeneChip Mouse Exon 1.0ST Array 小鼠外显子芯片
小鼠全转录本表达谱芯片，约有4个探针来针对每个外显子 / 约有40个探针来针对每个基因，覆盖经验性及预测的外显子序列，约1000000个外显子。可用于基因表达和可变剪切分析。
Affymetrix Plasmodium/Anopheles Genome Array 疟原虫
该芯片包括约4,300 Plasmodium falciparum 的转录子和约14,900 Anopheles gambiae 转录子。
Affymetrix Rhesus Macaque Genome Array 恒河猴
恒河猴基因芯片组点可以检测2004年10月前报道的Genbank, dbEST 和Unigene数据库中的47000个转录子，以及一些相关病毒的基因。
人炎症反应与自身免疫lncRNA PCR芯片（RT2 lncRNA PCR Array Human Inflammatory Response & Autoim
炎症反应与自身免疫LncRNA PCR芯片可以特异性检测84个与炎症相关的lncRNA。
基因分型芯片-Illumina小鼠和人的连锁分析
连锁分析芯片是进行疾病连锁分析的最佳工具，可以从家系基因型表现型和单基因型连锁不平衡中发现连锁关系。人类连锁分析芯片实验表明其成功率为99.8%，重复性>99.9%。
illumina全基因组snp分型芯片human610-quad
Human610-quad在一张芯片上可平行进行4个样品的检测，显著的增加了样本输出信息量，减少了实验操作中的误差。Human610-quad广泛的采用了HumanHap550芯片的内容，以及额外增加了60000个遗传标记。Human610