利用放射性或非放射性标记的已知核酸探针，通过放射自显影或非放射检测系统在组织、细胞及染色体上检测特异DNA或RNA序列的一种技术，是一种直接、简便的研究基因定位和表达的方法。即：将标记的核酸探针与细胞或组织中的核酸进行杂交，称为原位杂交，分为DNA-DNA、DNA-R

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贝瑞和康用新一代测序方法进行non-coding RNA分析的优势：1）不依赖参考基因组； 2）更加全面的发现新的非编码RNA；3）能够知道链的方向性。

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最新一代测序系统最高单序列读长可达1kb，读长较长，尤其适合于De novo测序和新物种的转录组测序。

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